Las infecciones de transmisión sexual pueden permanecer asintomáticas durante mucho tiempo; de hecho, los signos y síntomas pueden aparecer, dependiendo del tipo de infección, desde algunos días hasta incluso años después de la exposición. Algunas infecciones son leves y se resuelven en pocos días o semanas (como, por ejemplo, en el caso de una infección por Candida albicans) sin dejar consecuencias.

Otras veces (como en el caso del VIH o la sífilis), la progresión de la enfermedad puede conducir a complicaciones graves, en algunos casos incluso mortales. Algunas de estas infecciones, además, pueden desarrollarse de forma completamente asintomática durante mucho tiempo, provocando aun así alteraciones funcionales en ciertos órganos y deterioro de su funcionamiento (como ocurre, por ejemplo, con los daños en las trompas de Falopio causados por Chlamydia trachomatis, que pueden provocar infertilidad).